En una perspectiva interdisciplinar, el ITER desarrolla investigaciones vinculadas a la incidencia de la teología y de los estudios religiosos en la sociedad contemporánea; indaga en las relaciones entre religiones, cristianismo y pobreza en América Latina y busca comprender el fenómeno religioso y sus transformaciones en la sociedad contemporánea. En este sentido, se compone de dos grandes áreas de investigación: Teología y Estudios Religiosos. Cada una de estas áreas contiene líneas de investigación y grupos de estudios, desde los cuales se desarrollan diversas actividades, además de fomentar espacios de reflexión y discusión crítica sobre el catolicismo, la pobreza, entre otras temáticas.